EPR實施中的業(yè)務(wù)流程重組與ISO 9000的過程方法的理念是相似的，所開展活動的步驟也完全相同。所不同的是，BPR更強(qiáng)調(diào)“重組”和“再造”，ISO9000強(qiáng)調(diào)“識別”和“確定”。前者是按項目管理方法進(jìn)行的突破性改進(jìn)，由日常運(yùn)作之外的跨職能的小組來實施，如；EPR實施顧問小組。由于這種改進(jìn)的徹底性和全面性，所以改進(jìn)完成之后有一個相對的穩(wěn)定期；后者是由組織內(nèi)人員對現(xiàn)有過程進(jìn)行的持續(xù)改進(jìn)活動，相對穩(wěn)定的周期比較短，所以要求在識別和確定過程的順序和相互作用時，要考慮形成必要的體系文件和記錄，并確定過程的測量和監(jiān)視方法，以把握改進(jìn)的機(jī)會。 BPR和ISO9000過程方法的目的也是一致的，都是為了使過程增值。BPR通過對流程中的非增值環(huán)節(jié)進(jìn)行清除、簡化、整合、自動化來提高流程效率，使得流程更加合理與容易操作，這也是深化貫徹ISO9000標(biāo)準(zhǔn)的需要。在ISO90004中提出，管理者應(yīng)當(dāng)確保過程都以有效和高效的網(wǎng)絡(luò)方式運(yùn)作，還應(yīng)當(dāng)分析和優(yōu)化過程(包括產(chǎn)品實現(xiàn)過程和支付過程)。如果在識別和確定過程時，不考慮使過程增值的因素，或過程職責(zé)不明確，控制準(zhǔn)則不合理，則過程業(yè)績和有效性是不完善的，很有可能是將原有的，落后的、不合理的操作和管理程序的簡單描述或翻版。

BPR和ISO9000過程方法這二者根本區(qū)別在于對過程的改進(jìn)程度不同，企業(yè)在實行BPR時，所涉及的影響面較大，要停止和中斷原有流程，完全以新的流程代替之，操作人員對新的業(yè)務(wù)流程要重新熟悉，各方面投入的人力和物力也較大。而ISO9000采用PDCA漸進(jìn)式改進(jìn)，基本不需要停止和中斷原有業(yè)務(wù)流程，僅對不合理之處作局部調(diào)整，操作人員也容易上手，也不需要投入很大的人力物力。

基于以上的分要析，在考慮ERP與ISO9004的結(jié)合時，識別在何種程度上采用BPR或過程方法是必要的。一般說來，對于ERP中產(chǎn)生靜態(tài)數(shù)據(jù)(基礎(chǔ)數(shù)據(jù))的過程(或流程)，如：生產(chǎn)計劃和控制過程，應(yīng)該采用BPR的方法以確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性。另外，對于受人為因素影響較少、程序化程度高，主要由計算機(jī)來完成的活動，如文件管理，也可以采用這種方法。但對于一些難以程序化、主要由人來完成的活動，如內(nèi)部審核、應(yīng)采用過程方法來控制。對于一些部分由計算機(jī)執(zhí)行、部分由人來完成且呈規(guī)律性變化的流程，在經(jīng)過業(yè)務(wù)流程重組區(qū)分出由人和計算機(jī)執(zhí)行的任務(wù)后，通過在ERP系統(tǒng)中建立可用戶化的動態(tài)模型是適宜的。

對于一個企業(yè)的管理體系來說，BPR與過程方法是持續(xù)、互動地發(fā)揮著各自的作用。一方面，ISO9000標(biāo)準(zhǔn)要求對QMS及其過程進(jìn)行持續(xù)改進(jìn)，通過過程方法的PDCA循環(huán)反映企業(yè)質(zhì)量活動運(yùn)作的變化和改進(jìn)。另一方面，對于通過ISO9000質(zhì)量管理體系內(nèi)審和監(jiān)督審核所發(fā)現(xiàn)的不合理項，有些必須采用突破性改進(jìn)的方法，也就是BPR來實施改進(jìn)，以達(dá)到符合標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定的要求。BPR需要重新設(shè)計現(xiàn)有流程，考慮崗位職責(zé)的合理設(shè)置、績效考核指標(biāo)的切實應(yīng)用、管理制度的不斷規(guī)范使其趨于合理化。用改進(jìn)后的流程替代原有流程后，還應(yīng)將改進(jìn)后的目標(biāo)流程與事先確定的績效目標(biāo)進(jìn)行對照，評價是否達(dá)到既定的目標(biāo)。這個過程也是一個PDCA循環(huán)，通過策劃、實施、檢查、改進(jìn)、過程方法為企業(yè)BPR的持續(xù)改進(jìn)給出了方向和手段，同時保證了目標(biāo)業(yè)務(wù)流程的真正實現(xiàn)。