HACCP系統包含有七大原則，以確認制程中之危害及監控主要管制點，以防止危害的發生，此七大原則如下：

一、危害分析及危害程度評估

由原料、制造過程、運輸至消費的食品生產過程之所有階段，分析其潛在的危害，評估加工中可能發生的危害以及控制此危害之管制項目(PreventativeMeasures,PMs)。

二、主要管制點

決定加工中能去除此危害或是降低危害發生率的一個點、操作或程序的步驟，此步驟能是生產或是制造中的任何一個階段，包括原料、配方及(或)生產、收成、運輸、調配、加工和儲存等。

三、管制界限

為確保CCP在控制之下所建立的CCP之管制之界限。

四、監測方法

建立監測CCP之程序，可以測試或是觀察進行監測。

五、矯正措施

當監測系統顯示CCP未能在控制之下時，需建立的矯正措施(CorrectiveAction,CA)。

六、建立資料記錄和文件保存

建立所有程序之資料紀錄，并保存文件，以利紀錄、追蹤。

七、建立確認程序
 
建立確認之程序，以確定HACCP系統是在有效的執行。可以稽核之方式，收集輔助性之資料或是以印證HACCP計劃是否實施得當。確認之主要范圍為：

1、用科學方法確認CCP之控制界限。

2、確認工廠之HACCP計劃之功能。包括有終產品之檢驗﹐HACCP計劃之審閱﹐CCP紀錄的審閱及確認各個步驟是否執行。

3.內部稽核。包括有工作日志的審閱及流程圖和CCP的確認。

4.外部稽核及符合政府相關法令之確認。